Differenze

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--- matematica:asd:asd_18:progetto_18 [18/05/2019 alle 16:21 (6 anni fa)] – creata Roberto Grossi
+++ matematica:asd:asd_18:progetto_18 [30/05/2019 alle 13:22 (6 anni fa)] (versione attuale) – Roberto Grossi
@@ Linea 6: / Linea 6: @@
 Il progetto richiede di:
-  * Scaricare uno dei file di input da ?????
+  * Scaricare uno dei file di input, dove k=99: [[https://drive.google.com/open?id=1-7JPRTYm43cw_BGhf6l5xOZLWbuo3s1a&usp=drive_fs|10^5 read]], [[https://drive.google.com/open?id=1-GmbCiCAe2EWQ2m6JuHVjrHe024stbNV&usp=drive_fs|10^6 read]], [[https://drive.google.com/open?id=1-KJFY8boKbn4gkkhBrKgHubozzl20-sv&usp=drive_fs|10^7 read]] (fonte:[[https://github.com/felipelouza/egap/tree/master/dataset]]).
-  * Costruire il corrispondente grafo di de Bruijn.
+  * Costruire il corrispondente grafo di de Bruijn (per fare una prova utilizzare questi read con k=9: [[https://drive.google.com/file/d/1OlwH8Wz03DDonTt4kfomXaQaJC_0EjuA/view?usp=sharing|small read]]).
   * Progettare delle opportune strutture dei dati per rispondere alle seguenti operazioni di ricerca (dove la terza utilizza la seconda), per una stringa P di lunghezza arbitraria m > k:
     - stabilire se P appare come sequenza di caratteri che occorrono lungo uno dei cammini del grafo;
     - trovare il più lungo prefisso di P che soddisfa la condizione della 1;
     - eseguire la 1 dove P può avere un errore: uno dei suoi simboli non corrisponde, ma gli altri sì (es. trova anche AGCC o ATCT specificando P = ATCC perché differiscono in un solo simbolo che non corrisponde).